AIS е относително нова технология, която намери приложение след 2000 година, която въпреки ценната информация която осигурява, не е задължителна и не намира пълно приложение във всички видове кораби, като:
Средния радиус на покритие на AIS системата се приема около 40 морски мили и силно се влияе от мощността на предавателя, височината на антената и атмосферните условия. В много случаи тази дистанция спада под 20 мили, при много добри атмосферни условия достига до над 350 морски мили.
Допълнителни ограничения са свързани с качеството на данните, като съществуват различни източници на грешки. Например AIS транспондерът може да бъде изключен за определен период от време от капитана на кораба или да се появи техническа неизправност. Грешки в GPS позиционирането пък водят до невярно излъчена позиция на кораба. Голяма част от данните свързани с рейса на кораба се въвеждат ръчно от капитана, което е източник да допълнителни грешки като невярна или остаряла информация, грешно въведени размери на кораба, газене и др.
AIS-B от една страна не е задължителна за малките кораби, а от друга страна е с ограничена мощност от 2 вата, което ограничава радиуса на покритие до около 10 морски мили. Информацията при тези кораби се излъчва на значително по редки интервали от време.
